se puede añadir codec ac3 a reproductor Jwplayer , plyr?

codec ac3

Si y no, podes editarlos y forzarlos a que lo hagan pero vas a terminar destruyendo el reproductor... así se logró que reproduzca MKV pero siempre tiene que ser formato MIME (https://developer.mozilla.org/es/docs/Web/HTTP/Basics_of_HTTP/MIME_types) ya que el problema viene en los navegadores y no en los reproductores... por ej si hicieras una aplicación externa podrías usar JWPlayer + edición para que si te tome, pero estarías usando los codecs reconocidos por el sistema operativo y no por el navegador... por ende, te toca convertir